Ford memperkenalkan facelift pertama untuk generasi kedua Mondeo pada tahun 2003, setelah hanya dua tahun setengah dari peluncurannya, pada November 2000. Sementara itu masih merupakan pemimpin pasar di beberapa negara, Mondeo MKII menerima pembaruan di musim panas tahun 2003. Carmaker memperkenalkan fitur baru dan beberapa perubahan pada interior. Perubahan itu tidak diperlukan untuk drivetrain karena norma-norma polusi berikut diperkenalkan pada tahun 2005 ketika Ford meluncurkan facelift kedua untuk mobil yang hanya berlangsung tujuh tahun di pasar. Dari luar, satu-satunya perubahan yang nyata adalah untuk grille, yang menampilkan chrome di sekitar dan grille mesh honeycomb. Bumper juga ditingkatkan, dengan diperkenalkannya lampu kabut yang lebih besar dalam selongsong yang berbeda. Di sisi, sinyal belokan yang dipasang pada fender transparan bukannya oranye. Di belakang, lampu belakang menampilkan lensa transparan untuk sinyal belokan pada tahun 2003, bukan merah. Di dalam, Ford meningkatkan atau mengubah beberapa bagian untuk meningkatkan kualitas mobil. Misalnya, itu menandatangani kesepakatan dengan Sony untuk menyediakan unit CD-Radio, yang jauh lebih baik diintegrasikan ke dalam tumpukan tengah. Tombol dan switch lain menerima desain yang ditingkatkan. Untuk lineup engine, Ford berani memperkenalkan unit 3.0 liter Bensin V6 untuk versi teratas. Karena pasar diesel Eropa meningkat dan menjadi sangat menarik bagi armada, merek Blue-oval meningkatkan unit TDCI 2.0 liter untuk menghasilkan 155 hp sebagai gantinya, 25 hp lebih dari pendahulunya.