Diperkenalkan pada tahun 1999, tiga tahun setelah Megane Coupe pertama keluar, model baru mobil menerima peningkatan yang hampir sama dengan megane dasar kontemporer. Kisi-kisi yang dirancang ulang yang dibagi menjadi dua bagian untuk melingkari lencana, lampu depan berbentuk ulang dan bumper depan yang dimodifikasi, semuanya diinstal pada coupe Megane 1999. Namun, edisi kedua Megane Coupe ini hanya disimpan dalam produksi selama tiga tahun, diganti pada tahun 2002 oleh Renault Megane Coupe-Cabrio, model yang lebih maju yang masih dalam produksi tahun ini.